2006年，我國就啟動了土壤重金屬污染普查，并于2009年完成，但數據一直未公布。參與普查研究的中國科學院生態(tài)環(huán)境研究中心副研究員黃益宗指出，一些地方開采礦產時，重金屬污染到農田，使得農作物和經濟作物污染加重，特別是在西南、中部、中南某些省份表現明顯。“本次普查的一個表現是，土壤污染面積在擴大。而煙草污染只是其中的一個方面，部分地區(qū)稻谷、蔬菜也存在重金屬污染的情況?！?/p>

浙江大學醫(yī)學院控煙研究中心主任楊廷忠教授告訴《中國經濟周刊》，一些煙草種植區(qū)離污染型工廠比較近，不僅“有毒土壤”對煙草造成了致命危害，污水和城市廢棄物也使煙草生長雪上加霜，形成了“二次中毒”。尤其是其中的重金屬物質，它們主要存在于40厘米以上的土層中，既不易轉移也不易被微生物分解，植物吸收是必然結果。

另有研究表明，煙葉中的鎘、鎳、鉛等重金屬元素的含量和土壤的PH值成負相關性，土壤越酸，重金屬的含量就越多。目前我國大量燃燒含硫煤，酸雨越來越多，土壤也自然受到影響。

根據這一理論，云南煙草怕是成了“出頭鳥”。素有“有色金屬王國”之稱的云南還身兼“煙草大戶”的身份，同時，云南的酸雨也一樣全國聞名。

紅云紅河集團技術中心人士在接受《中國經濟周刊》采訪時言辭謹慎，先是表明云南礦產資源豐富，土壤中含有較多的重金屬物質是在所難免；然后再三強調，重金屬物質的來源絕非土壤一種，如果煙農不使用煙草企業(yè)專門提供的煙葉肥，或者使用違規(guī)農藥都有可能導致有害物殘留。而且，他們早已關注煙草中重金屬含量與產區(qū)土壤等環(huán)境因素的關系，并聯合研究機構做了檢測和數據收集工作，最后根據調查選擇了污染相對較少的地區(qū)作為煙草產區(qū)。

全國最大的煙葉產區(qū)云南省曲靖市煙草專賣局生產管理部部長毛建書也證實說，現在很多煙草企業(yè)都選擇50公里以內沒有工業(yè)企業(yè)、森林覆蓋率較高的地區(qū)作為煙草種植區(qū)，農藥使用上也采取煙草公司的統(tǒng)一指導，確保原材料是“無公害煙葉”。但與此同時，他也坦承，“無公害煙葉”尚未大面積推廣。

也有專家懷疑煙草加工環(huán)節(jié)難逃其咎。比如，煙草在烘烤過程中會因為使用煤炭、木材等含有重金屬成分的輔料導致煙焦油、一氧化碳、芳香烴和重金屬等有害物質的產生。另外，人為添加香精香料也有可能產生有毒成分。